A ce stade, le résultat obtenu me convient parfaitement. Les temps de génération sont divisés par deux c'est parfait.

Merci pour votre aide.

GNU bash, version 4.1.2(1)-release (x86_64-redhat-linux-gnu)

#!/bin/bash
[...]
md5sum=`sed -e '1,/^'$BIN_SEPARATOR'$/d' "$FINAL_NAME" | md5sum - | awk '{print $1}'`
md5byte=`head -n200 "$FINAL_NAME" | grep -b "^MD5SUM=" | cut -d":" -f1`
dd if=<(echo -n MD5SUM=$md5sum) of=$FINAL_NAME bs=1 seek=$md5byte conv=notrunc
ddcommand="dd if=<(echo -n MD5SUM=$md5sum) of=$FINAL_NAME bs=1 seek=$md5byte conv=notrunc"
eval $ddcommand
dd if=<(echo -n MD5SUM=c7f0b9dfd40da9561253983c0ecc044f) of=webEnv_uninstall_1000.bin bs=1 seek=615 conv=notrunc

Les 3 méthodes pour le dd échouent :

dd: opening `<(echo -n MD5SUM=9d850edb583a8b36c1f9dc3bbcd51c7f)': No such file or directory

Par contre, si je lance la commande (avec ou sans variables) directement dans le terminal, ça fonctionne...

Pour localiser la ligne :

head -n50 mon_bash | grep -b "^MD5SUM="

On m'a proposé de le faire avec dd, mais je ne trouve pas comment.

Voici un exemple :

$ cat mon_bash
#!/bin/bash

# Début du fichier bash

MD5SUM="00000000000000000000000000000000"

# Suite du fichier bash

dd if=<(echo -n 6d2bf9d6ebe32f56c7ab8bdbb53d1e9f) of=mon_bash bs=1 seek=47 conv=notrunc

$ cat mon_bash
#!/bin/bash

# Début du fichier bash

MD5SUM="6d2bf9d6ebe32f56c7ab8bdbb53d1e9f"

# Suite du fichier bash

Oui mais dans ce cas, ma variable n'est plus déclarée en début de script, je ne peut donc plus récupérer sa valeur.

En recuperant la taille totale, tu peux recuperer la somme en fin, au moins en C.
Sinon en laissant exactement la place (MD5SUM="[MD5SUMMD5SUMMD5SUMMD5SUMMD5SUM]") pour l'insérer sans modifier la taille du fichier ?

Ajouter le md5sum en fin du bash+archive est peut être plus pratique. Tu sais combien d'octets tu écris en fin et donc tu sais les virer pour decompresser. A la création c'est juste un append au fichier bash+tar.gz et donc il faut juste caluler la somme sur le fichier total bash+tar.gz.

Oui mais dans ce cas, ma variable n'est plus déclarée en début de script, je ne peut donc plus récupérer sa valeur.

Pour info, j'ai fait un test de lecture séquentielle en PHP (pour aller vite) et ça marche parfaitement. La modification de ma ligne est instantanée car je ne lit que 20 lignes, modifie 1 ligne ensuite je m'arrête.

Au pire, si je ne trouve pas d'autres solutions, je serais obligé de faire un petit programme C... Mais c'est dommage d'en arriver là

On m'a proposé de le faire avec dd, mais je ne trouve pas comment.

La partie bash sert à extraire automatiquement le binaire, puis à déployer son contenu (il s'agit d'un tar.gz).
Il fait également tout un tas d'autres choses .

Actuellement, je créé mon tar.gz, je md5sum, je stock le hash dans le fichier sh, puis je rassemble le tout.
Ce que je souhaiterai, c'est éviter de passer par une archive intermédiaire et de créer mon tar.gz directement à la suite de mon sh (je divise ainsi par 2 les temps de création).

Cependant, en faisant comme ça je suis obligé de stocker mon hash dans le fichier final qui est gros, d'où mon problème de fichier temporaire.

La chaine à remplacer ne fait pas forcement le même nombre de bits.
Je remplace un marqueur par sa valeur.

MD5SUM="[MD5SUM]"

devient

MD5SUM="6a5bc1cc5f80a48b540bc09d082b5855"

Le but étant de construire mon fichier puis d'y stocker son hash pour des vérifications lors de son utilisation.

Ca veut dire que pour vérifier l'intégrité de ton fichier, tu fais l'opération inverse : lecture du md5sum stocké dans le fichier, le replacer par le pattern initial et calculer la somme md5 sur le fichier ?
L'idéal est de rajouter les octets md5sum en fin de fichier dans ce cas.