Étant tout récemment passé de LinuxMintKDE 13 à Kubuntu 12.10, je suis également confronté à ces problèmes de jack, rakarrack, qjackctl et je suis particulièrement déçu par le fait que "ça fonctionnait avant et ça ne marche plus du tout maintenant !!!".
Bref, j'ai testé le totu de LinuxMAO ; résultat : niet !!!

Si j'interviens, c'est parce que j'ai pu trouver une autre solution utilisant les paquets de KXStudio.

La méthode, en résumé...

1. Suppression des paquets récalcitrants (et je reste poli ) :

sudo apt-get remove jackd jackd2 qjackctl

2. Ajout des éléments de KXStudio :

sudo add-apt-repository ppa:kxstudio-team/kxstudio && sudo apt-get update && sudo apt-get install kxstudio-repos && sudo apt-get update

3. Réinstallation des paquets (avec éventuellement Cadence, qui me semble sympa) :

sudo apt-get install jackd jackd2 qjackctl cadence

4. - Ne pas oublier (en remplaçant "nom_de_l_utilisateur" par... le nom de l'utilisateur ) -

sudo usermod -a -G audio "nom_de_l_utilisateur"

5. Reboot

Voilà, c'est tout.
Les retours d'expérience sont les bienvenus.

Je te propose de faire un tour sur linuxmao pour les concepts généraux et, pour Jack, je te conseille plus particulièrement ce petit tuto.
Tu trouveras également là-bas, un forum qui répondra sans doute de manière plus spécifique à tes questions...

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