Impossible d'installer R

zanhoria · Le 08/02/2018, à 12:38

Bonjour,
lorsque j'essaie d'installer r en ligne de commande ainsi :

sudo apt-get install r-base r-base-dev

le terminal me renvoie ceci :

Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances       
Lecture des informations d'état... Fait
E: Impossible de trouver le paquet r-base
E: Impossible de trouver le paquet r-base-dev

Pourquoi est-il impossible de trouver les paquets et comment puis-je installer r sur ma machine ?
Merci par avance pour vos réponse !

Dernière modification par zanhoria (Le 08/02/2018, à 13:11)

xubu1957 · Le 08/02/2018, à 12:46

Bonjour,

Regarde cette discussion > Difficultés installation logiciel R [Résolu]

gl38 · Le 08/02/2018, à 12:49

As-tu essayé de commencer par

sudo apt-get update

Cordialement,
Guy

zanhoria · Le 08/02/2018, à 12:55

Je vais aller voir la conversation merci !
Avec cette commande :

sudo apt-get update

J'ai eu le retour suivant :

Désolé, essayez de nouveau.
[sudo] Mot de passe : 
Err:1 https://<miroir.cran>/bin/linux/<version.ubuntu> xenial InRelease
  Could not resolve host: <miroir.cran>
Err:2 [url]https://stat.ethz.ch/CRAN/bin/linux/ubuntu[/url] zesty/ InRelease                                           
  Connection timed out after 120001 milliseconds
Err:3 [url]http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu[/url] xenial InRelease                                                  
  Impossible d'initialiser la connexion à fr.archive.ubuntu.com: 80 (2001:860:f70a::2). - connect (101: Le réseau n'est pas accessible) [IP : 2001:860:f70a::2 80]
Err:4 [url]http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu[/url] xenial-updates InRelease                                          
  Impossible d'initialiser la connexion à fr.archive.ubuntu.com: 80 (2001:860:f70a::2). - connect (101: Le réseau n'est pas accessible) [IP : 2001:860:f70a::2 80]
Err:5 [url]http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu[/url] xenial-backports InRelease                                        
  Impossible d'initialiser la connexion à fr.archive.ubuntu.com: 80 (2001:860:f70a::2). - connect (101: Le réseau n'est pas accessible) [IP : 2001:860:f70a::2 80]

Dernière modification par zanhoria (Le 08/02/2018, à 13:10)

xubu1957 · Le 08/02/2018, à 12:58

Pour ajouter toi-même les balises code à tes précédents messages #1 et #4 :

Cliquer sur le lien « Modifier » en bas à droite du message
Sélectionner le texte
Cliquer sur le <> de l'éditeur de message

comme indiqué dans le : Retour utilisable de commande

et déjà demandé dans ta précédente discussion > [résolu] Acces Internet Ubuntu en machine virtuelle (virtualbox)

Voir règles du forum > tutoriel/howto_forum#balises_bbcode

Balise CODE :
C'est la balise à utiliser pour donner de longs messages d'erreurs, des contenus de fichiers de configuration, des commandes à taper, etc … Elle permet des messages plus "compacts", et est moins ambiguë que d'autres polices sur certains caractères.

_ _ _

Tu as quelle version d'Ubuntu ?

xenial

ou zesty

Depuis le 13 janvier 2018, Ubuntu 17.04 est en fin de vie (end of life, EOL). Elle ne profite plus de nouvelle mise à jour de sécurité et les paquets logiciels pour cette version sont déplacés dans des serveurs d'archive. Pour continuer à recevoir des mises à jour de sécurité, veuillez mettre à niveau votre version d'Ubuntu vers une version activement soutenue.

Dernière modification par xubu1957 (Le 08/02/2018, à 13:12)

zanhoria · Le 08/02/2018, à 13:09

ok merci pour l'info ! je débute sur le forum et aussi sur linux

Je suis sous ubuntu 16.04 (placé dans une machine virtuelle virtual box) sur un ordi sous windows .

xubu1957 · Le 08/02/2018, à 13:14

Err:2 [url]https://stat.ethz.ch/CRAN/bin/linux/ubuntu[/url] zesty/ InRelease

Il fallait prendre le paquet pour xenial.

zanhoria · Le 08/02/2018, à 14:13

Comment faire pour télécharger ce paquet ?

xubu1957 · Le 08/02/2018, à 14:21

Tu es allé sur leur site > https://cran.r-project.org/ ?

Choisir Download R for Linux > ubuntu > xenial

zanhoria · Le 08/02/2018, à 14:36

Je viens d'y aller, quand je suis ce chemin je tombe sur une liste de dizaines et de dizaines de fichiers.... je ne sais pas trop comment faire

xubu1957 · Le 08/02/2018, à 15:09

Et dans la page :

Installation
To obtain the latest R packages, add an entry like
Pour obtenir les derniers paquets R, ajoutez une entrée comme suit
deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu xenial/
in your /etc/apt/sources.list file, replacing <my.favorite.cran.mirror> by the actual URL of your favorite CRAN mirror. See https://cran.r-project.org/mirrors.html for the list of CRAN mirrors. To install the complete R system, use
dans votre fichier /etc/apt/sources. list, en remplaçant <my. favorite. cran. mirror> par l'URL actuelle de votre miroir CRAN préféré. Voir https://cran.r-project.org/mirrors.html pour la liste des miroirs CRAN. Pour installer le système R complet, utilisez :
sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base

?

zanhoria · Le 08/02/2018, à 15:13

J'ai en effet lu le readme mais en remplacant : <my.favorite.cran.mirror> par une adresse url trouvée sur le site des mirrors j'ai ceci :

bash: https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/: Aucun fichier ou dossier de ce type

xubu1957 · Le 08/02/2018, à 15:15

Regarde dans ce lien > how-to-install-r-on-ubuntu-16-04.

ou :

traduction a écrit :

Pour obtenir les derniers paquets R, ajoutez une entrée comme
deb http://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu xenial/
dans votre fichier /etc/apt/sources.list, en remplaçant <my.favorite.cran.mirror> par l'URL réelle de votre miroir CRAN préféré. Voir http://cran.r-project.org/mirrors.html pour la liste des miroirs CRAN.(...)

> problem-with-project-r-installation

Rajout - En regardant La Doc > via_un_mirroir_du_cran_version_plus_recente

La commande doit ressembler à :

sudo add-apt-repository "deb https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/"

Dernière modification par xubu1957 (Le 08/02/2018, à 15:36)

zanhoria · Le 12/02/2018, à 11:23

J'ai entré cette commande :

sudo add-apt-repository "deb https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/"

La console me demande mon mot de passe puis rien ne s'affiche
j'entre ensuite cette commande :

sudo apt-get update

j'ai alors la réponse suivante :

Err:1 https://<miroir.cran>/bin/linux/<version.ubuntu> xenial InRelease
  Could not resolve host: <miroir.cran>
Err:2 https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/ InRelease                                    
  Connection timed out after 120001 milliseconds
Err:3 https://stat.ethz.ch/CRAN/bin/linux/ubuntu zesty/ InRelease                                           
  Connection timed out after 120000 milliseconds
Err:4 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial InRelease                                                  
  Impossible d'initialiser la connexion à fr.archive.ubuntu.com: 80 (2001:860:f70a::2). - connect (101: Le réseau n'est pas accessible) [IP : 2001:860:f70a::2 80]
Err:5 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates InRelease                                          
  Impossible d'initialiser la connexion à fr.archive.ubuntu.com: 80 (2001:860:f70a::2). - connect (101: Le réseau n'est pas accessible) [IP : 2001:860:f70a::2 80]
Err:6 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-backports InRelease                                        
  Impossible d'initialiser la connexion à fr.archive.ubuntu.com: 80 (2001:860:f70a::2). - connect (101: Le réseau n'est pas accessible) [IP : 2001:860:f70a::2 80]
0% [Connexion à security.ubuntu.com (91.189.91.23)]

j'ai l'impression que mon terminal n'arrive pas à obtenir une connexion pour télécharger des paquets.
j'ai le même problème quand j'essaie de télécharger un autre logiciel via un wget :

 wget https://downloads.dataiku.com/public/studio/4.1.3/dataiku-dss-4.1.3.tar.gz

Pourtant malgré des problèmes de proxi que j'ai résolu, j'ai bien un accès internet à partir de linux (mozilla firefox).
Il s'agit d'un ubuntu 16.04 placé dans une machine virtuelle virutal box hébergé par un windows 7.

--2018-02-12 10:20:27--  https://downloads.dataiku.com/public/studio/4.1.3/dataiku-dss-4.1.3.tar.gz
Résolution de downloads.dataiku.com (downloads.dataiku.com)… 37.59.52.53
Connexion à downloads.dataiku.com (downloads.dataiku.com)|37.59.52.53|:443… échec : Connexion terminée par expiration du délai d'attente.
Nouvel essai.

--2018-02-12 10:22:38--  (essai :  2)  https://downloads.dataiku.com/public/studio/4.1.3/dataiku-dss-4.1.3.tar.gz
Connexion à downloads.dataiku.com (downloads.dataiku.com)|37.59.52.53|:443…

C'est la première fois que je rencontre ce type de problème, merci par avance pour votre aide

cordialement,
Aurore

Dernière modification par zanhoria (Le 12/02/2018, à 11:24)

xubu1957 · Le 12/02/2018, à 11:42

Bonjour,

Err:1 https://<miroir.cran>/bin/linux/<version.ubuntu> xenial InRelease
  Could not resolve host: <miroir.cran>
Err:2 https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/ InRelease                                    
  Connection timed out after 120001 milliseconds
Err:3 https://stat.ethz.ch/CRAN/bin/linux/ubuntu zesty/ InRelease                                           
  Connection timed out after 120000 milliseconds

Il y a deux demandes en trop.

inbox a écrit :

Salut,
En attendant que le serveur français redevienne joignable, change pour un autre.
A+

dans > Echec de mise à jour sous 16.04 [RESOLU]

D'autres informations dans > Difficultés installation logiciel R [Résolu]

Dernière modification par xubu1957 (Le 12/02/2018, à 11:53)

zanhoria · Le 12/02/2018, à 11:55

Qu'appellez-vous "demandes" ?
Il faut choisir un autre miroir ? Le problème vient du serveur ou de mon terminal?

zanhoria · Le 12/02/2018, à 12:28

Je me rends compte que j'ai ce problème pour installer n'importe quel logiciel, je voulais installer l’éditeur de texte geany également

aurore@aurore-VirtualBox:/home/disque_U$ sudo apt install geany
[sudo] Mot de passe de aurore : 
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances       
Lecture des informations d'état... Fait
E: Impossible de trouver le paquet geany

Lorque j'essaie d'uptater, cela ne fonctionne pas :

aurore@aurore-VirtualBox:/home/disque_U$ sudo apt-get update
[sudo] Mot de passe de aurore : 
Err:1 https://<miroir.cran>/bin/linux/<version.ubuntu> xenial InRelease
  Could not resolve host: <miroir.cran>
0% [Connexion à fr.archive.ubuntu.com (194.158.119.186)] [Connexion à security.ubuntu.com (91.189.88.161)]

D’où le problème peut-il venir ?
Merci énormément par avance pour votre aide,
Aurore

Dernière modification par zanhoria (Le 12/02/2018, à 13:11)

xubu1957 · Le 12/02/2018, à 13:40

Tu as essayé de changer les serveurs de téléchargement ?

Doc > software-properties#logiciels_ubuntu

extrait du § 4.1 a écrit :

...changer les serveurs de téléchargement en modifiant le champ "Télécharger depuis:" En choisissant l'entrée "autre…" vous aurez accès à tous les serveurs.
(...)

zanhoria · Le 12/02/2018, à 14:21

merci beaucoup, je viens d'essayer :
Ne sachant pas lequel choisir, j'ai choisi l'option " Selectionner le meilleur serveur"
en réponse j'ai eu ceci :Aucun serveur de téléchargement adapté n'a été trouvé Veuillez vérifier votre connexion Internet.
Pourtant j'ai bien accès à internet depuis mozilla firefox sous ubuntu.
Le proxi de mon ordinateur pourrait-il empêcher l'accès au serveur ?
merci par avance pour vos réponses

xubu1957 · Le 12/02/2018, à 14:23

Fais voir la liste des sources :

find /etc/apt -name '*.list' -exec bash -c 'echo -e "\n$1\n"; nl -ba "$1"' _ '{}' \;

Dernière modification par xubu1957 (Le 12/02/2018, à 14:23)

zanhoria · Le 12/02/2018, à 14:30

Bonjour,
au sein d'une entreprise j'ai installé sur mon poste de travail ubuntu 16.04 au sein d'une machine virtuelle grâce à virtual box, le tout sur un pc sous windows 7.
En paramétrant le proxy de mozilla firefox, j'ai accès à internet sur ubuntu.
cependant je ne peux télécharger aucun paquet ou mise à jour .... Lorsque je recherche dans logiciels et mises à jour, le meilleur serveur pour mes téléchargements, j'obteiens la réponse suivante :
Aucun serveur de téléchargement adapté n'a été trouvé.Veuillez vérifier votre connexion Internet.
Je pense que le proxy empeche la connexion au serveur.
Je ne sais pas du tout comment paramétrer le proxy ou autres afin de pouvoir télécharger des paquets sur ubuntu.
Je vous remercie beaucoup par avance pour votre aide et vos réponse,
cordialement,
Aurore

Nasman · Le 12/02/2018, à 14:38

Pour le téléchargement des paquets, il faut indiquer d'utiliser un proxy en allant dans Réseau puis serveur mandataire (ou proxy). Cela mettra à jour le fichier /etc/apt/apt.conf
Le paramétrage du proxy pour firefox n'a pas d'incidence sur le téléchargement des paquets par apt & co

zanhoria · Le 12/02/2018, à 14:48

merci beaucoup, avec la commande que tu m'a donnée j'ai ce retour ( je ne comprends pas ce qu'elle signifie):

/etc/apt/souces.list

     1	# deb cdrom:[Ubuntu 16.04.3 LTS _Xenial Xerus_ - Release amd64 (20170801)]/ xenial main restricted
     2	
     3	# See http://help.ubuntu.com/community/UpgradeNotes for how to upgrade to
     4	# newer versions of the distribution.
     5	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial main restricted
     6	# deb-src http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial main restricted
     7	
     8	## Major bug fix updates produced after the final release of the
     9	## distribution.
    10	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates main restricted
    11	# deb-src http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial-updates main restricted
    12	
    13	## N.B. software from this repository is ENTIRELY UNSUPPORTED by the Ubuntu
    14	## team. Also, please note that software in universe WILL NOT receive any
    15	## review or updates from the Ubuntu security team.
    16	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial universe
    17	# deb-src http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial universe
    18	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates universe
    19	# deb-src http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial-updates universe
    20	
    21	## N.B. software from this repository is ENTIRELY UNSUPPORTED by the Ubuntu 
    22	## team, and may not be under a free licence. Please satisfy yourself as to 
    23	## your rights to use the software. Also, please note that software in 
    24	## multiverse WILL NOT receive any review or updates from the Ubuntu
    25	## security team.
    26	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial multiverse
    27	# deb-src http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial multiverse
    28	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates multiverse
    29	# deb-src http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial-updates multiverse
    30	
    31	## N.B. software from this repository may not have been tested as
    32	## extensively as that contained in the main release, although it includes
    33	## newer versions of some applications which may provide useful features.
    34	## Also, please note that software in backports WILL NOT receive any review
    35	## or updates from the Ubuntu security team.
    36	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-backports main restricted universe multiverse
    37	# deb-src http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial-backports main restricted universe multiverse
    38	
    39	## Uncomment the following two lines to add software from Canonical's
    40	## 'partner' repository.
    41	## This software is not part of Ubuntu, but is offered by Canonical and the
    42	## respective vendors as a service to Ubuntu users.
    43	# deb http://archive.canonical.com/ubuntu xenial partner
    44	# deb-src http://archive.canonical.com/ubuntu xenial partner
    45	
    46	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-security main restricted
    47	# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security main restricted
    48	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-security universe
    49	# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security universe
    50	deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-security multiverse
    51	deb https://<miroir.cran>/bin/linux/<version.ubuntu>/ xenial main
    52	# deb-src https://<miroir.cran>/bin/linux/<version.ubuntu>/ xenial main
    53	deb https://stat.ethz.ch/CRAN/bin/linux/ubuntu zesty/
    54	# deb-src https://stat.ethz.ch/CRAN/bin/linux/ubuntu zesty/
    55	deb https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/
    56	# deb-src https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/
    57	# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security multiverse

Edit : suppression des balises url pour rendre sources.list plus lisible

Dernière modification par cqfd93 (Le 12/02/2018, à 16:27)

zanhoria · Le 12/02/2018, à 14:55

Merci beaucoup !
je suis allée dans réseau -> serveur mandataire : méthode automatique, URL de configuration : la même que j'ai entré pour la configuration du proxy dans firefox
j'ai alors cliqué sur appliquer à tout le système (mais je n'ai pas eu l'impression que cela fasse quelque chose)
j'ai réessayé de réinstallé un paquet à partir de la console mais cela ne fonctionne malheureusement toujours pas ...

sudo apt-get update
Err:1 https://<miroir.cran>/bin/linux/<version.ubuntu> xenial InRelease
  Could not resolve host: <miroir.cran>
0% [Connexion à archive.ubuntu.com (91.189.88.152)]^C

Dernière modification par zanhoria (Le 12/02/2018, à 14:57)

Nasman · Le 12/02/2018, à 15:22

A mon taf il y a aussi un proxy mais sans authentification, en rentrant les infos de façon manuelle, ip ou nom serveur proxy et port, cela fonctionne.

Il y a peut être aussi un problème du fait que tu sois en machine virtuelle

Effectue le test en démarrant une session "Live" (donc sans utiliser une machine virtuelle)

Dernière modification par Nasman (Le 12/02/2018, à 15:24)

Ubuntu-fr

Navigation

Liens de recherche

Annonce

#1 Le 08/02/2018, à 12:38

Impossible d'installer R

#2 Le 08/02/2018, à 12:46

Re : Impossible d'installer R

#3 Le 08/02/2018, à 12:49

Re : Impossible d'installer R

#4 Le 08/02/2018, à 12:55

Re : Impossible d'installer R

#5 Le 08/02/2018, à 12:58

Re : Impossible d'installer R

#6 Le 08/02/2018, à 13:09

Re : Impossible d'installer R

#7 Le 08/02/2018, à 13:14

Re : Impossible d'installer R

#8 Le 08/02/2018, à 14:13

Re : Impossible d'installer R

#9 Le 08/02/2018, à 14:21

Re : Impossible d'installer R

#10 Le 08/02/2018, à 14:36

Re : Impossible d'installer R

#11 Le 08/02/2018, à 15:09

Re : Impossible d'installer R

#12 Le 08/02/2018, à 15:13

Re : Impossible d'installer R

#13 Le 08/02/2018, à 15:15

Re : Impossible d'installer R

#14 Le 12/02/2018, à 11:23

Re : Impossible d'installer R

#15 Le 12/02/2018, à 11:42

Re : Impossible d'installer R

#16 Le 12/02/2018, à 11:55

Re : Impossible d'installer R

#17 Le 12/02/2018, à 12:28

Re : Impossible d'installer R

#18 Le 12/02/2018, à 13:40

Re : Impossible d'installer R

#19 Le 12/02/2018, à 14:21

Re : Impossible d'installer R

#20 Le 12/02/2018, à 14:23

Re : Impossible d'installer R

#21 Le 12/02/2018, à 14:30

Re : Impossible d'installer R

#22 Le 12/02/2018, à 14:38

Re : Impossible d'installer R

#23 Le 12/02/2018, à 14:48

Re : Impossible d'installer R

#24 Le 12/02/2018, à 14:55

Re : Impossible d'installer R

#25 Le 12/02/2018, à 15:22

Re : Impossible d'installer R

Pied de page des forums