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Marzikill

Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

Bonjour à tous !

Ma prof d'SVT m'a donné un travail profondément débile, et je souhaiterai créer un script pour le faire à ma place...

Mais je débute, et j'ai quelques menus problèmes :

#!/bin/bash
# Version Alpha Bêta Omega Delta, bref un truc qui ressemble à rien

for i in $*
do
case "$i" in 
`echo A` ) echo -n T;;
`echo U` ) echo -n A;;
`echo G` ) echo -n C;;
`echo C` ) echo -n G;;
esac
done

echo ""

En fait, je voudrais que le script recherche dans les arguments les "U" pour les transformer en "A", les "A" en "T", les "G" en "C", les "C" en "G".

Mais je souhaiterai pouvoir entrer ma mes varibles sans laisser d'espaces, entre.
Comment faire ?

C'est clair ?

Amicalement
Marzikill.

Dernière modification par Marzikill (Le 14/11/2008, à 21:55)

Chiuchu

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

Salut,

Je ne pourrai pas t'aider, mais pourquoi t'obliges-tu à le faire en shell ? Essaye un langage plus facile pour le traitement de chaines ...

Par contre, je trouve qu'on peut te décerner la palme du geek en herbe.

++

---

Article L. 122-1 du code de la consommation

obiwankennedy

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

public class SvtTranslator {

	/**
	 * @param args
	 */
	public static void main(String[] args) 
	{
		String argument = args[0];
		String traduit = new String();
		for(int i = 0; i<argument.length();i++)
		{
			if(argument.charAt(i)=='A')
				traduit+='T';
			else if (argument.charAt(i)=='U')
				traduit+='A';
			else if (argument.charAt(i)=='G')
				traduit+='C';
			else if (argument.charAt(i)=='C')
				traduit+='G';
			
		}
		
		System.out.println(traduit);
	}

}

Code vite fait en java.
Donc le copier/coller dans un fichier nommer SvtTranslator.java
javac SvtTranslator.java
java SvtTranslator UAU
ATA

---

Dans mes logiciels, j'écris ton nom.
SGNGD: SvgGd is Not GD
Rolisteam

qqun

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

ben bash c'est bien aussi

VAR=$1
SIZ=${#VAR}
for ((i=0;i<SIZ;i++))
do
	CAR=${VAR:$i:1}	
	case "$CAR" in 
		A ) echo -n T;;
		U ) echo -n A;;
		G ) echo -n C;;
		C ) echo -n G;;
	esac
done

echo ;echo

Marzikill

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

Oui, j'avais pensé le faire en C (ce qui je pense aurait pas trop posé de difficulté) mais comme j'essaie d'apprendre le Bash, j'ai trouvé que ce serai un bon exercice d'application !

Merci qqn, ça marche du tonnerre ! Je vais faire encore sûrement quelques modifications, pour avoir un affichage sous forme de triplets (trois lettres par trois lettres).

Amicalement
Marzikill.

Lonewolf

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

J'ai l'impression d'avoir 20 ans de moins et de replancher sur les chaînes ADN-ARN

Et comme a dit Chiuchu, tu décroches la palme du geek

Kanor

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

Allez un petit essai en python

dict = {"U":"A","A":"T","G":"C", "C":"G"}
i = 'UAGCUUCGAUC'
print "".join([dict[k] for k in list(i)])

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Un blog avec du mordant
Liste de bons liens pour apprendre python et plus

alexduf

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

Pfou !, je suis en train d'apprendre python en ce moment, et quand je vois la simplicité avec laquelle on réalise certaine tâches... c'est bluffant.
Faut vraiment que j'oublie tout ce que j'ai pu apprendre en java.

nicolas66

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

Et comme a dit Chiuchu, tu décroches la palme du geek

Le comble ça serait de l'écrire en brainf*ck

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"The computer was born to solve problems that did not exist before." (B. Gates)

Kanor

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

alexduf je te conseil ce tuto
http://python.developpez.com/cours/DiveIntoPython/php/frdiveintopython/toc/index.php
Je pense que c'est la seul doc qui utilise vraiment le style de programmation python

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obiwankennedy

Re : Un chtit script pour embêter ma prof d'SVT

en perl

perl -e '$parle = "ATA";$parle =~ tr/[AUGC]/[TACG]/;print "$parle\n";'

Remplacez ATA par la vrai chaine.

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SGNGD: SvgGd is Not GD
Rolisteam