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PDemong

[Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Bonjour,
je reviens d'un examen IRM, avec un beau CD contenant des séries de prise de mon genou au format DICOM.
Pour le lire, j'ai essayé entre autre Ginkgo CADx, avec le paquet par défaut dans Ubuntu. Il est un peu vieux, mais il se lance.

J'ouvre (Open File) le fichier DICOMDIR et on me propose d'acquérir des séries de prises IRM, puis l'acquisition plante avec le message :

Unable to open modality MR with transfer syntax 1.2.840.10008.1.2.1

Il doit me manquer un paquet, mais je n'arrive pas à déterminer lequel. Quelqu'un aurait-il une idée svp ?
Merci,
Patrick

Dernière modification par PDemong (Le 26/06/2012, à 04:16)

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Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Salut,

Je sais que ce n'est pas la réponse attendue, mais dans les dépôts, il y a le paquet amide qui permet de lire les fichiers DICOM.

A+

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PDemong

Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

il y a le paquet amide qui permet de lire les fichiers DICOM.

Oui merci, et il y en a plusieurs autres en fait. J'en ai listé une partie dans cette discussion.
Amide n'a pas fonctionné dans mon cas. J'ouvrirai peut-être une discussion sur ce problème ultérieurement.

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Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Pour éclaircir ton message d'erreur, je pense, d'après la page DICOM de Wikipédia, que MR corespond à Magnetic Resonance. Le message a donc un rapport direct avec un champ du type d'image (images IRM).

Sur cette même page de documentation, on trouve l'explication de ce à quoi correspond "1.2.840.10008.1.2.1". Il s'agit de l'encodage des données DICOM (Explicit VR Little Endian).

Reste à comprendre ce que signifie ton message d'erreur.

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PDemong

Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Il s'agit de l'encodage des données DICOM (Explicit VR Little Endian).

Merci pour ta recherche. J'avais trouvé aussi cette info sur une autre page.

Je suis en train de me faire aider sur le forum de l'application Ginkgo CADx directement. Je leur poste plein de logs en mode debug, il semble y avoir un plugin manquant dans le paquet Ubuntu.
Dès qu'on trouve une solution, je poste ici.

arnaud_d

Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

J'ai eu le même problème et ai trouvé la solution ici.

Ainsi, il te faut éditer en root le fichier /usr/lib/ginkgocadx/Plugins/visualizator.inf :

$ sudo gedit /usr/lib/ginkgocadx/Plugins/visualizator.inf

et remplacer la première ligne par

DLL=libvisualizator.so

Ensuite fait la même chose avec le fichier /usr/lib/ginkgocadx/Plugins/lightvisualizator.inf sauf qu'il te faut remplacer la première ligne par

DLL=liblightvisualizator.so

Chez moi, tout marche depuis.

EDIT : ok je suis un demeuré, je viens de te recopier ton propre message. Bon bha j'ai donné la solution ici au moins. Pense à passer la discussion en [résolu]. Si tu as le temps, remercie cbruiz sur l'autre site qui t'as donné la solution, c'est cool de sa part.

Dernière modification par arnaud_d (Le 14/06/2012, à 22:21)

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PDemong

Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Merci arnaud_d, je ne savais même pas qu'il y avait eu du nouveau sur l'autre post!
Du coup, grâce à toi, je suis au courant 
Je vais essayer le fix ce soir en rentrant chez nous avant de mettre le sujet à Résolu.

PDemong

Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Et hop! Résolu!

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Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Une petite explication serait la bienvenue.

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PDemong

Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Je n'ai malheureusement pas vraiment d'explication sur ce problème.
Par contre la solution est parfaitement décrite par arnaud_d dans le post #6 ci-dessus .

Principitomain

Re : [Résolu][12.04] Ginkgo CADx : problème de lecture - imagerie médicale

Fonctionne aussi pour moi. Impecc' !!
Merci