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Clouding: comment faire pour ne pas tout re-télécharger après réinstal

Bonjour,

Je me pose une question bête, je sauvegarde mes documents importants en clouding (d'abord sur Ubuntu one puis à sa fermeture sur Hubic), le problème c'est que j'ai réinstallé Ubuntu en formatant tous mes disques durs, évidemment j'avais sauvegardé les mêmes documents importants sur un disque dur externe et je les ai remis dans mon répertoire personnel après réinstallation.
Quand je réinstalle le client de clouding celui-ci re-télécharge tous les documents présents sur mon disque dur sur le cloud en changeant le nom des fichiers...

Comment faire pour éviter ça et faire en sorte de ne télécharger que les documents qui ont été modifiés?

Merci d'avance pour vos réponse.
J'espère avoir été clair dans mon explication si vous vouliez des renseignements supplémentaires n'hésitez pas à demander.