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#1 Le 12/01/2019, à 15:49

yvan19

Impossible d'installer R et Rstudio

j ai installe R depuis quelque jours, mais maintenant j arrive pas a ouvrir r-studio et aussi j arrive pas a installer r une nouvelle fois voici le message qu'on m affiche:

Les paquets suivants contiennent des dépendances non satisfaites :
 r-base : Dépend: r-base-core (>= 3.2.5-1precise0) mais ne sera pas installé
          Dépend: r-recommended (= 3.2.5-1precise0) mais ne sera pas installé
          Recommande: r-base-html mais ne sera pas installé
E: Impossible de corriger les problèmes, des paquets défectueux sont en mode « garder en l'état ».

De plus quand je double clic sur le logiciel Rstudio installe, j'obtiens le message suivant:

Unable to find an installation of R on the system (which R didn't return valid output); Unable to locate R binary by scanning standard locations

je suis debutant sur ubuntu .

Dernière modification par yvan19 (Le 12/01/2019, à 17:14)

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#2 Le 12/01/2019, à 15:54

inbox

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Salut,

Que donne cette commande ?

lsb_release -d

A+


Un problème résolu ? Indiquez le en modifiant le titre du sujet.
Linux user 449594

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#3 Le 12/01/2019, à 16:12

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Merci. j'obtiens ceci:
Description:    Ubuntu 16.04.5 LTS

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#4 Le 12/01/2019, à 16:37

inbox

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Comme ton système est en version 16.04 et que tu as tenté d'installer une vieille version, soit la 12.04 alias Precise, as-tu ajouté un dépôt supplémentaire ? Pour le savoir, donne le retour de :

ls -ls /etc/apt/sources.list.d/

Un problème résolu ? Indiquez le en modifiant le titre du sujet.
Linux user 449594

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#5 Le 12/01/2019, à 16:46

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Je ne pense pas que j'ai ajoute un depot supplementaire. j'ignore car je suivait des indications sur certaines pages.
j'ai suivi les instructions de cette page https://doc.ubuntu-fr.org/r
le code donne ceci:

total 60
4 -rw-rw-r-- 1 root root 181 janv. 12 14:41 aims-sagemath-trusty.list
4 -rw-rw-r-- 1 root root 130 févr.  8  2018 aims-sagemath-trusty.list.distUpgrade
4 -rw-rw-r-- 1 root root 181 janv. 12 14:41 aims-sagemath-trusty.list.save
4 -rw-r--r-- 1 root root 117 janv. 12 14:41 dropbox.list
4 -rw-r--r-- 1 root root  66 févr.  8  2018 dropbox.list.distUpgrade
4 -rw-r--r-- 1 root root 117 janv. 12 14:41 dropbox.list.save
4 -rw-r--r-- 1 root root 231 janv. 12 14:41 google-talkplugin.list
4 -rw-r--r-- 1 root root 180 févr.  8  2018 google-talkplugin.list.distUpgrade
4 -rw-r--r-- 1 root root 231 janv. 12 14:41 google-talkplugin.list.save
4 -rw-rw-r-- 1 root root 185 janv. 12 14:41 jtaylor-ipython-trusty.list
4 -rw-rw-r-- 1 root root 134 févr.  8  2018 jtaylor-ipython-trusty.list.distUpgrade
4 -rw-rw-r-- 1 root root 185 janv. 12 14:41 jtaylor-ipython-trusty.list.save
4 -rw-r--r-- 1 root root 107 janv. 12 14:41 skype-stable.list
4 -rw-r--r-- 1 root root  56 févr.  8  2018 skype-stable.list.distUpgrade
4 -rw-r--r-- 1 root root 107 janv. 12 14:41 skype-stable.list.save

Dernière modification par yvan19 (Le 12/01/2019, à 17:12)

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#6 Le 12/01/2019, à 16:49

inbox

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Cela ne te dispense pas de répondre à la question.

En complément, donne le retour de :

dpkg -l "r-*"

Un problème résolu ? Indiquez le en modifiant le titre du sujet.
Linux user 449594

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#7 Le 12/01/2019, à 16:55

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

j'ai bien note.
Comme remarque: j'utilisais bien avant rstudio et suite a l'installation de anaconda3, debut des problemes:
du coup j'ai tout desintalle pour recommencer a zero mais helas!
le code donne ceci

Souhait=inconnU/Installé/suppRimé/Purgé/H=à garder
| État=Non/Installé/fichier-Config/dépaqUeté/échec-conFig/H=semi-installé/W=attend-traitement-déclenchements
|/ Err?=(aucune)/besoin Réinstallation (État,Err: majuscule=mauvais)
||/ Nom            Version      Architecture Description
+++-==============-============-============-=================================
un  r-base         <aucune>     <aucune>     (aucune description n'est disponi
un  r-base-core    <aucune>     <aucune>     (aucune description n'est disponi
un  r-cran-ggplot2 <aucune>     <aucune>     (aucune description n'est disponi
un  r-cran-plyr    <aucune>     <aucune>     (aucune description n'est disponi
un  r-cran-reshape <aucune>     <aucune>     (aucune description n'est disponi
un  r-recommended  <aucune>     <aucune>     (aucune description n'est disponi

Dernière modification par yvan19 (Le 12/01/2019, à 17:11)

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#8 Le 12/01/2019, à 17:01

xubu1957

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Bonjour,

Pour ajouter toi-même les balises code à tes précédents messages #1, #5 et #7 :               Merci               wink

  • Cliquer sur  le lien « Modifier » en bas à droite du message

  • Sélectionner le texte

  • Cliquer sur le <> de l'éditeur de message

1530289742.png

comme indiqué dans le : Retour utilisable de commande
_ _ _

Voir règles du forum > balises BB code

Balise CODE :

C'est la balise à utiliser pour donner de longs messages d'erreurs, des contenus de fichiers de configuration, des commandes à taper, etc … Elle permet des messages plus "compacts", et est moins ambiguë que d'autres polices sur certains caractères.

alca94 a écrit :

1539072593.png

Dernière modification par xubu1957 (Le 12/01/2019, à 17:07)


Important : Pensez à passer vos sujets en [Résolu] lorsque ceux-ci le sont, au début du titre en cliquant sur Modifier sous le premier message, et un bref récapitulatif de la solution à la fin de celui-ci. Merci.

Xubuntu 18.04.1 LTS - Lenovo T410 -Toshiba Satellite A300  Membre de Linux-Azur

En ligne

#9 Le 12/01/2019, à 17:15

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Merci pour l'explication detaillee. je crois que j'ai bien utilise la balise maintenant

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#10 Le 12/01/2019, à 17:18

inbox

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Pour le moment, je ne trouve pas ce qui cloche.

Donne le retour de :

cat /etc/apt/sources.list
apt show r-base
apt-cache madison r-base

Un problème résolu ? Indiquez le en modifiant le titre du sujet.
Linux user 449594

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#11 Le 12/01/2019, à 17:19

xubu1957

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Les retours sont bons.

Dernière modification par xubu1957 (Le 12/01/2019, à 17:19)


Important : Pensez à passer vos sujets en [Résolu] lorsque ceux-ci le sont, au début du titre en cliquant sur Modifier sous le premier message, et un bref récapitulatif de la solution à la fin de celui-ci. Merci.

Xubuntu 18.04.1 LTS - Lenovo T410 -Toshiba Satellite A300  Membre de Linux-Azur

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#12 Le 12/01/2019, à 17:21

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

sortie cat /etc/apt/sources.list

# Ubuntu
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/ cdroot/dists/trusty/main/binary-amd64/
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/ cdroot/dists/trusty/main/binary-i386/
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/ cdroot/dists/trusty/restricted/binary-amd64/
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/ cdroot/dists/trusty/restricted/binary-i386/
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/ trusty main restricted
deb http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu/ xenial main universe multiverse restricted
deb-src http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu/ xenial main universe multiverse restricted #Added by software-properties
# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu trusty main universe multiverse restricted
deb http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu/ xenial-updates main universe multiverse restricted
deb-src http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu/ xenial-updates main universe multiverse restricted #Added by software-properties
# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu trusty-updates main universe multiverse restricted
deb http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu/ xenial-backports main universe multiverse restricted
deb-src http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu/ xenial-backports main universe multiverse restricted #Added by software-properties
# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu trusty-backports main universe multiverse restricted
deb http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu/ xenial-security main universe multiverse restricted
deb-src http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu/ xenial-security main universe multiverse restricted #Added by software-properties
# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu trusty-security main universe multiverse restricted

# Canonical Partner
deb http://archive.canonical.com/ubuntu xenial partner
deb-src http://archive.canonical.com/ubuntu xenial partner

# AIMS Desktop PPA
# deb http://ppa.launchpad.net/aims/aims-desktop/ubuntu xenial main # désactivé pour la mise à niveau vers xenial
# deb-src http://ppa.launchpad.net/aims/aims-desktop/ubuntu trusty main

# deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu trusty/ # désactivé pour la mise à niveau vers xenial
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/
# deb-src https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/
deb https://cran.biotools.fr/bin/linux/xenial/ xenial main
# deb-src https://cran.biotools.fr/bin/linux/xenial/ xenial main
deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/

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#13 Le 12/01/2019, à 17:23

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

sortie apt show r-base

Package: r-base
Version: 3.5.2-1cosmic
Priority: optional
Section: gnu-r
Maintainer: Dirk Eddelbuettel <edd@debian.org>
Installed-Size: 61,4 kB
Depends: r-base-core (>= 3.5.2-1cosmic), r-recommended (= 3.5.2-1cosmic)
Recommends: r-base-html, r-doc-html
Suggests: ess, r-doc-info | r-doc-pdf
Homepage: http://www.r-project.org/
Download-Size: 42,0 kB
APT-Sources: https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/ Packages
Description: système de calcul statistique et de graphique GNU R
 R est un système de calcul statistique et de graphiques. Il est composé
 d'un langage ainsi que d'un environnement d'exécution avec des graphiques,
 un débogueur, un accès à certaines fonctions systèmes et la possibilité
 d'exécuter des programmes stockés dans des fichiers scripts.
 .
 La conception de R a été fortement influencée par deux langages existants
 : le S de Becker, Chambers et Wilks et le Scheme de Sussman. Le langage
 obtenu est très proche en apparence du S alors que l'implémentation sous-
 jacente et la sémantique dérive du Scheme.
 .
 Le cœur de R est un langage de calcul interprété qui permet les
 branchements et les boucles ainsi que la programmation modulaire en
 utilisant des fonctions. La plupart des fonctions visibles par les
 utilisateurs sont écrites en R. Il est possible d'utiliser des procédures
 écrites en C, C++ ou FORTRAN pour plus d'efficacité, et la plupart des
 fonctions internes de R le font. La distribution R contient des
 fonctionnalités pour un large panel de procédures statistiques et de
 calculs mathématiques. Elle contient également un grand nombre de
 fonctions qui fournissent un environnement graphique flexible pour créer
 différents types de présentations des données.
 .
 En outre, plusieurs milliers de « paquets » d'extension sont disponibles à
 partir de CRAN, le réseau complet d'archives R, et beaucoup sont aussi
 disponibles sous forme de paquets Debian nommés « r-cran-<nom> ».
 .
 Ce paquet est un méta-paquet pour faciliter la transition de la
 configuration du paquet pre-1.5.0 avec le paquet principal r-base. Une
 fois installé, ce paquet peut être supprimé en toute sécurité, apt-get
 continuera à mettre à jour automatiquement ses composants dans les futures
 mises à jour. Fournir ce paquet est un moyen donné aux utilisateurs de
 n'installer que r-base-core s'ils le souhaitent.

N: Il y a 15 enregistrements supplémentaires. Veuillez utiliser l'opérande « -a » pour les voir.

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#14 Le 12/01/2019, à 17:25

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

sortie apt-cache madison r-base

    r-base | 3.5.2-1cosmic | https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/ Packages
    r-base | 3.5.1-2cosmic | https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/ Packages
    r-base | 3.4.4-1xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.4.3-1xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.4.2-2xenial2 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.4.2-1xenial1 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.4.1-2xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.4.1-1xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.4.0-1xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.3.3-1xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.3.2-1xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.3.1-1xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.3.0-2xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.3.0-1xenial0 | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base | 3.2.5-1xenial | http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages
    r-base |    3.2.3-4 | http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu xenial/universe amd64 Packages
    r-base |    3.2.3-4 | http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu xenial/universe i386 Packages
    r-base |    3.2.3-4 | http://la-mirrors.evowise.com/ubuntu xenial/universe Sources

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#15 Le 12/01/2019, à 17:27

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Complement d'infos: lorsque que je tape R dans recherche
sur Ubuntu, j'obtiens juste le logiciel de Rstudio et sous une forme
bizarre (pas le setup habituel)
Merci

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#16 Le 12/01/2019, à 17:30

inbox

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Enfin une piste !

Tu as ajouté trois sources différentes pour installer R ! Ce n'est pas parce que tu vas les multiplier, que cela va arranger les choses.
Tu supprimes toutes les lignes suivantes :

# deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu trusty/ # désactivé pour la mise à niveau vers xenial
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/
# deb-src https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/
deb https://cran.biotools.fr/bin/linux/xenial/ xenial main
# deb-src https://cran.biotools.fr/bin/linux/xenial/ xenial main
deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/

Pour éditer le fichier, entre cette commande dans un terminal :

sudo nano /etc/apt/sources.list

Ensuite, il faut voir si tu as vraiment besoin de la dernière version sortie ou si la version des dépôt te suffit. En fonction de ta réponse, on avisera.


Un problème résolu ? Indiquez le en modifiant le titre du sujet.
Linux user 449594

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#17 Le 12/01/2019, à 17:39

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Merci bien. j'ai entre le code et j'obtiens ceci:

# Ubuntu
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/$
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/$
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/$
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/$
# deb cdrom:[AIMS Desktop 14.04.2-20150722 0.01 __ - Release amd64 (19700101)]/$
deb http://ftp.rezopole.net/ubuntu/ xenial main universe multiverse restricted
deb-src http://ftp.rezopole.net/ubuntu/ xenial main universe multiverse restric$
# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu trusty main universe multiverse rest$
deb http://ftp.rezopole.net/ubuntu/ xenial-updates main universe multiverse res$
deb-src http://ftp.rezopole.net/ubuntu/ xenial-updates main universe multiverse$
# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu trusty-updates main universe multive$
deb http://ftp.rezopole.net/ubuntu/ xenial-backports main universe multiverse r$
deb-src http://ftp.rezopole.net/ubuntu/ xenial-backports main universe multiver$
# deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu trusty-backports main universe multi$
deb http://ftp.rezopole.net/ubuntu/ xenial-security main universe multiverse re$
deb-src http://ftp.rezopole.net/ubuntu/ xenial-security main universe multivers$
# deb-src http://security.ubuntu.com/ubuntu trusty-security main universe multi$

                            [ Lecture de 33 lignes ]
^G Aide      ^O Écrire    ^W Chercher  ^K Couper    ^J Justifier ^C Pos. cur.
^X Quitter   ^R Lire fich.^\ Remplacer ^U Coller    ^T Orthograp.^_ Aller lig.

J'ignore comment proceder (excusez-moi je suis vraiment novice sur Linux).
Cependant, je n'ai pas vraiment  besoin de la derniere version (je desirais comme c'est souvent recommande).
J'opte pour ce que vous me suggerer. Merci

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#18 Le 12/01/2019, à 17:43

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

S'il vous plait comment je peux proceder pour supprimer lignes ci-dessus que vous
m'avez demande?

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#19 Le 12/01/2019, à 17:46

inbox

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Quand tu ne connais pas, le 1er réflexe est de consulter la documentation du forum. En l'occurrence, la page sur nano.

Pour supprimer des lignes, déplaces toi avec les flèches de direction et supprimes avec la touche "Suppr".


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Linux user 449594

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#20 Le 12/01/2019, à 18:09

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Merci beaucoup. je viens de le faire.
pour repondre a la question precedente qui conditionne la suite,
je reste indifferent et j'opte pour ce que vous me suggerer.
en effet, je desirais la derniere version parce que c'est souvent recommandee.

Merci

Hors ligne

#21 Le 12/01/2019, à 18:54

inbox

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Pour installer Rstudio, tu dois l'installer après que R lui même soit bien installé.

Maintenant que tu as fait le ménage, on va voir si R s'installe. Passe la commande suivante et donne le retour :

sudo apt clean && sudo apt update && sudo apt install r-base

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Linux user 449594

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#22 Le 12/01/2019, à 19:30

yvan19

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Oui merci. R s'est bien installé.
dans la barre de recherche, quand je tape, R je l'observe bien et ça fonctionne.
Je me demande si je dois encore installer Rstudio car dans la barre
de recherche le Setup de rstudio apparaisse et quand je double clic, il s'ouvre normalement.
Ce pendant dans mes dossiers juste le dossier R est créé et pas le dossier R_libs comme avant.

Je crains d'executer le code

sudo apt-get install rstudio

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#23 Le 12/01/2019, à 21:43

inbox

Re : Impossible d'installer R et Rstudio

Tu ne peux pas installer Rstudio par une commande car il n'est pas disponible dans les dépôts. Par contre, tu peux le supprimer puis le réinstaller comme la 1ère fois.


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Linux user 449594

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