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#1 Le 03/05/2007, à 17:03

vectron

PYTHON et recherche PUBMED

Salut à tous,

je débute sous python mais j'ai déja en projet bien en tête. Je souhaite faire un outil de recherche dans le base de données médicale Pubmed. Il en existe déja un (BIBUS = équivalent de END NOTE) mais je veux construire le mieux! L'idéal serait de le faire fonctionner sans installer plus d'un fichier car à mon boulot pas possible d'installer quoi que se soit sauf copier un fichier sur son bureau. J'arrive à bien faire fonctionner Tkinter mais pour parser le site cela devient un peu plus compliqué. Je crois qu'il existe une extension pour interroger cette base de données ? Y a t-il des personnes interrésser pour monter un projet simple pour commencer (simplement récuperer des références et les sauvegarder) ? Mon autre projet est un simulateur de PIC (pression intra cranienne...). Merci.:D

pubmed-www-nlm.gif

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/quer … ifruanglib


Les pepites de Doc Brown : http://pepites80.blogspot.com/ - les années 80.

Hors ligne

#2 Le 03/05/2007, à 21:38

ptit.o

Re : PYTHON et recherche PUBMED

il existe déjà un module qui fait cela, il se trouve dans le paquet BioPython http://www.biopython.org.

Je m'en suis déjà servis plusieurs fois, de plus avec la lecture du cookbook tu devrais pouvoir y arriver.