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#1 Le 02/03/2023, à 11:07

voigi

pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Bonjour ,

je n'arrive pas à  dumper (exporter) mes databases à partir de dbeaver vers un fichier local !!


voici le message d'erreur (un probléme de permissions semble -t il )

Error executing process
  Cannot run program "/run/user/1000/doc/8efdc4f/bin/mysqldump" (in directory "/run/user/1000/doc/8efdc4f/bin"): error=13, Permission denied
  Cannot run program "/run/user/1000/doc/8efdc4f/bin/mysqldump" (in directory "/run/user/1000/doc/8efdc4f/bin"): error=13, Permission denied
    error=13, Permission denied
    error=13, Permission denied
bruno a écrit :

Non tu dois remettre les droits tels qu'il étaient à l'installation de MySQL
A minima, ceci :

sudo chown -R root:root /etc/mysql/conf.d/
sudo chmod -R a+rX /etc/mysql/conf.d/

les permissions avait changé

Dernière modification par voigi (Le 03/03/2023, à 10:03)

Hors ligne

#2 Le 02/03/2023, à 12:23

xubu1957

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Bonjour,

Donne le retour de :

sudo apt update

et d'éventuels paquets cassés :

dpkg -l | grep -v ^ii

Conseils pour les nouveaux demandeurs et pas qu'eux
Important : Pensez à passer vos sujets en [Résolu] lorsque ceux-ci le sont, au début du titre en cliquant sur Modifier sous le premier message, et un bref récapitulatif de la solution à la fin de celui-ci. Merci.                   Membre de Linux-Azur

Hors ligne

#3 Le 02/03/2023, à 12:29

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

sudo apt update

[sudo] Mot de passe de voigi : 
Atteint :1 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic InRelease
Réception de :2 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-updates InRelease [118 kB]
Atteint :3 https://dl.google.com/linux/chrome/deb stable InRelease             
Atteint :4 http://cz.archive.ubuntu.com/ubuntu jammy InRelease                 
Réception de :5 http://security.ubuntu.com/ubuntu kinetic-security InRelease [109 kB]
Atteint :6 https://ppa.launchpadcontent.net/cappelikan/ppa/ubuntu kinetic InRelease
Atteint :7 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu jammy InRelease                 
Réception de :8 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-backports InRelease [99,9 kB]
Atteint :9 https://ppa.launchpadcontent.net/maarten-fonville/android-studio/ubuntu kinetic InRelease
Ign :10 https://proget.hunterwittenborn.com makedeb InRelease                  
Réception de :11 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-updates/main amd64 Packages [323 kB]
Réception de :12 https://proget.hunterwittenborn.com makedeb Release [7608 B] 
Réception de :13 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-updates/main i386 Packages [175 kB]
Réception de :14 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-updates/restricted i386 Packages [25,7 kB]
Réception de :15 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-updates/restricted amd64 Packages [226 kB]
Atteint :16 https://repo.waydro.id jammy InRelease                             
Réception de :18 http://security.ubuntu.com/ubuntu kinetic-security/main i386 Packages [105 kB]
Réception de :19 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-updates/universe amd64 Packages [192 kB]
Réception de :20 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-updates/universe i386 Packages [110 kB]
Réception de :21 http://security.ubuntu.com/ubuntu kinetic-security/main amd64 Packages [233 kB]
Réception de :22 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu kinetic-updates/multiverse amd64 Packages [6280 B]
Réception de :23 http://security.ubuntu.com/ubuntu kinetic-security/main Translation-en [62,2 kB]
Réception de :24 http://security.ubuntu.com/ubuntu kinetic-security/main amd64 DEP-11 Metadata [28,6 kB]
Réception de :25 http://security.ubuntu.com/ubuntu kinetic-security/restricted amd64 Packages [225 kB]
Réception de :26 http://security.ubuntu.com/ubuntu kinetic-security/restricted Translation-en [35,9 kB]
Réception de :27 http://security.ubuntu.com/ubuntu kinetic-security/universe amd64 DEP-11 Metadata [4464 B]
2086 ko réceptionnés en 2s (870 ko/s)                                
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances... Fait
Lecture des informations d'état... Fait      
14 paquets peuvent être mis à jour. Exécutez « apt list --upgradable » pour les voir.

dpkg -l | grep -v ^ii

Souhait=inconnU/Installé/suppRimé/Purgé/H=à garder
| État=Non/Installé/fichier-Config/dépaqUeté/échec-conFig/H=semi-installé/W=attend-traitement-déclenchements
|/ Err?=(aucune)/besoin Réinstallation (État,Err: majuscule=mauvais)
||/ Nom                                           Version                                     Architecture Description
+++-=============================================-===========================================-============-================================================================================
rc  android-studio-2021.3.1                       2021.3.1.17~kinetic+0                       amd64        Android Studio
rc  hplip-gui                                     3.22.6+dfsg0-1                              all          HP Linux Printing and Imaging - GUI utilities (Qt-based)
rc  linux-image-5.19.0-23-generic                 5.19.0-23.24                                amd64        Signed kernel image generic
rc  linux-image-5.19.0-26-generic                 5.19.0-26.27                                amd64        Signed kernel image generic
rc  linux-image-5.19.0-28-generic                 5.19.0-28.29                                amd64        Signed kernel image generic
rc  linux-modules-5.19.0-23-generic               5.19.0-23.24                                amd64        Linux kernel extra modules for version 5.19.0 on 64 bit x86 SMP
rc  linux-modules-5.19.0-26-generic               5.19.0-26.27                                amd64        Linux kernel extra modules for version 5.19.0 on 64 bit x86 SMP
rc  linux-modules-5.19.0-28-generic               5.19.0-28.29                                amd64        Linux kernel extra modules for version 5.19.0 on 64 bit x86 SMP
rc  linux-modules-extra-5.19.0-23-generic         5.19.0-23.24                                amd64        Linux kernel extra modules for version 5.19.0 on 64 bit x86 SMP
rc  linux-modules-extra-5.19.0-26-generic         5.19.0-26.27                                amd64        Linux kernel extra modules for version 5.19.0 on 64 bit x86 SMP
rc  linux-modules-extra-5.19.0-28-generic         5.19.0-28.29                                amd64        Linux kernel extra modules for version 5.19.0 on 64 bit x86 SMP
rc  virtualbox-7.0                                7.0.6-155176~Ubuntu~jammy                   amd64        Oracle VM VirtualBox
rc  virtualbox-ext-pack                           6.1.38-1                                    all          extra capabilities for VirtualBox, downloader.

Hors ligne

#4 Le 02/03/2023, à 13:50

bruno

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Bonjour,

Comment dbeaver a-il été installé ?
Je parie que c'est un encore un snap qui pose problème…

Hors ligne

#5 Le 02/03/2023, à 13:57

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

je confirme que ça été installé via un snap

Hors ligne

#6 Le 02/03/2023, à 13:58

xubu1957

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

On voit un mélange de 22.04 jammy et 22.10 kinetic.

Fournis les noyaux présents :

echo; dpkg -l | awk '!/^rc/ && / linux-(c|g|h|i|lo|m|si|t)/{print $1,$2,$3,$4 | "sort -k3V | column -t"}' ; echo -e "\nNoyau courant : $(uname -mr)"

du fait de la présence de mainline, le ppa cappelikan.
        _ _ _

(edit=messages regroupés)
        _ _ _

Montre :

snap list

Dernière modification par xubu1957 (Le 02/03/2023, à 14:01)


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Hors ligne

#7 Le 02/03/2023, à 13:59

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

echo; dpkg -l | awk '!/^rc/ && / linux-(c|g|h|i|lo|m|si|t)/{print $1,$2,$3,$4 | "sort -k3V | column -t"}' ; echo -e "\nNoyau courant : $(uname -mr)"

ii  linux-headers-5.15.0-25                     5.15.0-25.25                all
ii  linux-headers-5.15.0-25-generic             5.15.0-25.25                amd64
ii  linux-image-5.15.0-25-generic               5.15.0-25.25                amd64
ii  linux-modules-5.15.0-25-generic             5.15.0-25.25                amd64
ii  linux-headers-5.15.5-051505                 5.15.5-051505.202111250933  all
ii  linux-image-unsigned-5.15.5-051505-generic  5.15.5-051505.202111250933  amd64
ii  linux-modules-5.15.5-051505-generic         5.15.5-051505.202111250933  amd64
ii  linux-headers-5.19.0-23                     5.19.0-23.24                all
ii  linux-headers-5.19.0-23-generic             5.19.0-23.24                amd64
ii  linux-headers-5.19.0-26                     5.19.0-26.27                all
ii  linux-headers-5.19.0-26-generic             5.19.0-26.27                amd64
ii  linux-headers-5.19.0-28                     5.19.0-28.29                all
ii  linux-headers-5.19.0-28-generic             5.19.0-28.29                amd64
ii  linux-headers-5.19.0-29                     5.19.0-29.30                all
ii  linux-headers-5.19.0-29-generic             5.19.0-29.30                amd64
ii  linux-image-5.19.0-29-generic               5.19.0-29.30                amd64
ii  linux-modules-5.19.0-29-generic             5.19.0-29.30                amd64
ii  linux-modules-extra-5.19.0-29-generic       5.19.0-29.30                amd64
ii  linux-headers-5.19.0-31                     5.19.0-31.32                all
ii  linux-headers-5.19.0-31-generic             5.19.0-31.32                amd64
ii  linux-image-5.19.0-31-generic               5.19.0-31.32                amd64
ii  linux-modules-5.19.0-31-generic             5.19.0-31.32                amd64
ii  linux-modules-extra-5.19.0-31-generic       5.19.0-31.32                amd64
ii  linux-generic                               5.19.0.31.28                amd64
ii  linux-generic-hwe-22.04                     5.19.0.31.28                amd64
ii  linux-headers-generic                       5.19.0.31.28                amd64
ii  linux-headers-generic-hwe-22.04             5.19.0.31.28                amd64
ii  linux-image-generic                         5.19.0.31.28                amd64
ii  linux-image-generic-hwe-22.04               5.19.0.31.28                amd64
ii  linux-headers-6.2.0-060200                  6.2.0-060200.202302191831   all
ii  linux-headers-6.2.0-060200-generic          6.2.0-060200.202302191831   amd64
ii  linux-image-unsigned-6.2.0-060200-generic   6.2.0-060200.202302191831   amd64
ii  linux-modules-6.2.0-060200-generic          6.2.0-060200.202302191831   amd64

Noyau courant : 5.19.0-31-generic x86_64

Hors ligne

#8 Le 02/03/2023, à 14:01

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

snap list

Nom                             Version              Révision  Suivi            Éditeur        Notes
bare                            1.0                  5         latest/stable    canonical✓     base
chromium                        110.0.5481.177       2356      latest/stable    canonical✓     -
citra-emu                       C2306-N1800          345       latest/stable    nightmayr      -
code                            92da9481             120       latest/stable    vscode✓        classic
core                            16-2.58.2            14784     latest/stable    canonical✓     core
core18                          20230207             2697      latest/stable    canonical✓     base
core20                          20230126             1822      latest/stable    canonical✓     base
core22                          20230210             522       latest/stable    canonical✓     base
cups                            2.4.2-5              872       latest/stable    openprinting✓  -
dbeaver-ce                      22.3.4.202302041940  220       latest/stable    dbeaver-corp   -
discord                         0.0.25               150       latest/stable    snapcrafters   -
dolphin-emulator                5.0-17893            904       latest/edge      nightmayr      -
eclipse                         2022-12              66        latest/stable    snapcrafters   classic
firefox                         110.0.1-2            2391      latest/stable/…  mozilla✓       -
gh                              2.6.0-15-g1a10fd5a   502       latest/stable    casper-dcl     -
gnome-3-38-2004                 0+git.6f39565        119       latest/stable/…  canonical✓     -
gnome-42-2204                   0+git.0c1a50b        56        latest/stable    canonical✓     -
gtk-common-themes               0.1-81-g442e511      1535      latest/stable/…  canonical✓     -
gtk2-common-themes              0.1                  13        latest/stable    canonical✓     -
nightmayr-kf5-qt-5-15-2-core20  5.85.0               30        latest/stable    nightmayr      -
onlyoffice-desktopeditors       7.3.0                144       latest/stable    onlyoffice✓    -
p7zip-desktop                   16.02.2              220       latest/stable    ernytech       -
postman                         9.31.0               184       v9/stable        postman-inc✓   -
shotcut                         22.12.21             929       latest/stable    meltytech✓     classic
snap-store                      41.3-66-gfe1e325     638       latest/stable/…  canonical✓     -
snapd                           2.58.2               18357     latest/stable    canonical✓     snapd
snapd-desktop-integration       0.1                  57        latest/stable/…  canonical✓     -

Dernière modification par voigi (Le 02/03/2023, à 14:01)

Hors ligne

#9 Le 02/03/2023, à 14:04

xubu1957

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Pour dbeaver, je ne sais pas aider ! ¯∖_(ツ)_/¯

Dernière modification par xubu1957 (Le 02/03/2023, à 14:04)


Conseils pour les nouveaux demandeurs et pas qu'eux
Important : Pensez à passer vos sujets en [Résolu] lorsque ceux-ci le sont, au début du titre en cliquant sur Modifier sous le premier message, et un bref récapitulatif de la solution à la fin de celui-ci. Merci.                   Membre de Linux-Azur

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#10 Le 02/03/2023, à 14:08

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

plus précisément c MySQLDump qui gére l'export dans dbeaver

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#11 Le 02/03/2023, à 15:16

bruno

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Vire le snap et installe le paquet deb disponible ici : https://dbeaver.io/download/

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#12 Le 02/03/2023, à 15:38

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Presque , on avance un peu !!

mysqldump: [ERROR] Stopped processing the 'includedir' directive in file /etc/mysql/my.cnf at line 20.

Task 'MySQL dump' finished at Thu Mar 02 15:35:25 CET 2023
/usr/bin/mysqldump --skip-lock-tables --routines --add-drop-table --disable-keys --extended-insert -u ****** --host=localhost --port=3306 pokemon
Task 'MySQL dump' started at Thu Mar 02 15:35:25 CET 2023
mysqldump: File '/etc/mysql/conf.d/mysql.cnf' not found (OS errno 13 - Permission denied)

mysqldump: [ERROR] Stopped processing the 'includedir' directive in file /etc/mysql/my.cnf at line 20.

mysqldump: File '/etc/mysql/conf.d/mysqldump.cnf' not found (OS errno 13 - Permission denied)

mysqldump: [ERROR] Stopped processing the 'includedir' directive in file /etc/mysql/my.cnf at line 20.

Task 'MySQL dump' finished at Thu Mar 02 15:35:25 CET 2023
/usr/bin/mysqldump --skip-lock-tables --routines --add-drop-table --disable-keys --extended-insert -u ****** --host=localhost --port=3306 sys
Task 'MySQL dump' started at Thu Mar 02 15:35:25 CET 2023
mysqldump: File '/etc/mysql/conf.d/mysql.cnf' not found (OS errno 13 - Permission denied)

mysqldump: [ERROR] Stopped processing the 'includedir' directive in file /etc/mysql/my.cnf at line 20.

mysqldump: File '/etc/mysql/conf.d/mysqldump.cnf' not found (OS errno 13 - Permission denied)

mysqldump: [ERROR] Stopped processing the 'includedir' directive in file /etc/mysql/my.cnf at line 20.

mysqldump: Couldn't execute 'SHOW FIELDS FROM `schema_table_statistics`': View 'sys.schema_table_statistics' references invalid table(s) or column(s) or function(s) or definer/invoker of view lack rights to use them (1356)

Task 'MySQL dump' finished at Thu Mar 02 15:35:26 CET 2023
2023-03-02 15:35:26.291 - IO error: Process failed (exit code = 2). See error log.
2023-03-02 15:35:26.291 - java.io.IOException: Process failed (exit code = 2). See error log.
	at org.jkiss.dbeaver.tasks.nativetool.AbstractNativeToolHandler.validateErrorCode(AbstractNativeToolHandler.java:242)
	at org.jkiss.dbeaver.tasks.nativetool.AbstractNativeToolHandler.executeProcess(AbstractNativeToolHandler.java:223)
	at org.jkiss.dbeaver.tasks.nativetool.AbstractNativeToolHandler.doExecute(AbstractNativeToolHandler.java:262)
	at org.jkiss.dbeaver.ext.mysql.tasks.MySQLNativeToolHandler.doExecute(MySQLNativeToolHandler.java:47)
	at org.jkiss.dbeaver.tasks.nativetool.AbstractNativeToolHandler.lambda$0(AbstractNativeToolHandler.java:83)
	at org.jkiss.dbeaver.runtime.RunnableContextDelegate.lambda$0(RunnableContextDelegate.java:39)
	at org.eclipse.jface.operation.ModalContext$ModalContextThread.run(ModalContext.java:122)

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#13 Le 02/03/2023, à 15:46

bruno

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Il y a une erreur sur un fichier, existe-t’il et quels sont les droits d'accès :

  ls -l /etc/mysql/conf.d/mysql.cnf

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#14 Le 02/03/2023, à 15:47

bruno

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Modération : je déplace le sujet, ce n'est pas un problème de programmation mais un problème de configuration et d'utilisation du serveur MySQL.

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#15 Le 02/03/2023, à 16:00

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

je viens de reinstaller le paquet mysql server: toujours le meme soucis

  ls -l /etc/mysql/conf.d/mysql.cnf

-rw------- 1 mysql mysql 8 oct.  20  2020 /etc/mysql/conf.d/mysql.cnf

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#16 Le 02/03/2023, à 16:11

bruno

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Ce n'est pas normal les fichiers sous /etc/mysql/conf.d devrait appartenir à root et être accessible en lecture pour tous.

EDIT : je viens de vérifier le paquet mysql-common pour kinetic et c'est bien le cas. Tu as donc modifié les propriétaires et les droits de ces fichiers.

Dernière modification par bruno (Le 02/03/2023, à 16:13)

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#17 Le 02/03/2023, à 16:13

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

le proprietaire est MysqlServer

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#18 Le 02/03/2023, à 16:15

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

dois je reinstaller mysql-common?

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#19 Le 02/03/2023, à 16:25

bruno

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Non tu dois remettre les droits tels qu'il étaient à l'installation de MySQL
A minima, ceci :

sudo chown -R root:root /etc/mysql/conf.d/
sudo chmod -R a+rX /etc/mysql/conf.d/

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#20 Le 02/03/2023, à 16:31

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

ça va mieux :

Task 'MySQL dump' started at Thu Mar 02 16:30:20 CET 2023
mysqldump: Couldn't execute 'SHOW FIELDS FROM `schema_table_statistics`': View 'sys.schema_table_statistics' references invalid table(s) or column(s) or function(s) or definer/invoker of view lack rights to use them (1356)

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#21 Le 02/03/2023, à 16:50

bruno

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

L'erreur est explicite : il y a un problème avec ta requête qui fait référence à une table, colonne ou fonction non valable ou des droits insuffisants (je ne fais que traduire le message d'erreur).

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#22 Le 02/03/2023, à 17:16

voigi

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Je pense qu'on peut mettre en résolu. La table problématique étant une table de config . Les tables créés manuellement ont bien été exportée. Merci pour tout

Dernière modification par voigi (Le 02/03/2023, à 17:17)

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#23 Le 02/03/2023, à 17:41

nany

Re : pb dump database dbeavear[RESOLU]                                     

Bonjour,



Maintenant que le problème semble réglé, je me permets un petit hors sujet.

voigi a écrit :
…
Atteint :4 http://cz.archive.ubuntu.com/ubuntu jammy InRelease                 
…
Atteint :7 http://fr.archive.ubuntu.com/ubuntu jammy InRelease                 
…
Atteint :16 https://repo.waydro.id jammy InRelease                             
…

Que viennent faire des sources jammy (dont une partie émane d’un serveur tchèque) dans un environnement qui semble être en version kinetic ?

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